Los microorganismos, denominados también microbios o gérmenes, son seres vivos diminutos, generalmente formados por una única célula.

Se encuentran por doquier y algunos de ellos pueden sobrevivir en ambientes hostiles (altas temperaturas, falta de oxígeno, carencia de nutrientes) o resistir a los medicamentos creados para combatirlos (resistencia bacteriana).

Existen varios tipos de microorganismos: bacterias, virus, hongos, levaduras.

Se denominan «patógenos» los microorganismos peligrosos para la salud, y «comensales», aquellos que desempeñan sobre todo funciones beneficiosas y de ayuda para el organismo.